Pour déterminer la capacité d'échange cationique (CEC), l'échantillon séché broyé est saturé en acétate d'ammonium : les ions ammonium prennent ainsi la place des autres cations dans leurs sites cationiques. L'échantillon est ensuite rincé plusieurs fois à l'alcool : les ions n'occupant aucun site cationique sont éliminés de l'échantillon. Par une solution d'extraction (chlorure de sodium), les ions ammoniums sont délogés de leurs sites cationiques par les ions sodium puis récupérés dans le filtrat. Chaque filtrat est dosé par le spectro-photo-colorimètre à flux continu afin de déterminer la concentration en ions ammoniums et par conséquent la capacité d'échange cationique.